10月16日0—24時，云南省新增報告確診病例2例，為境外輸入病例（瑞麗市）。當日新增治愈出院病例14例，解除醫學觀察的密切接觸者14例。
境外輸入現有確診病例174例。累計確診病例1146例，累計治愈出院病例972例，無死亡病例。
截至10月16日24時，全省現有確診病例174例，累計治愈出院病例1364例，累計死亡病例2例，累計報告確診病例1540例。累計追蹤到密切接觸者29015人，尚在醫學觀察的密切接觸者347人。
全省新增無癥狀感染者2例（瑞麗市抵邊嚴管區重點人群定期核酸檢測中發現1例，隴川縣集中隔離場所核酸檢測發現1例），解除醫學觀察4例；尚在醫學觀察的無癥狀感染者61例（境外輸入53例）。
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